Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
CBFBQ13951 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CBFBQ13951 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFBQ13951 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms