Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CACNA1SQ13698 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
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