Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRQ13535 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRQ13535 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRQ13535 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRQ13535 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRQ13535 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRQ13535 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRQ13535 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRQ13535 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRQ13535 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRQ13535 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRQ13535 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRQ13535 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRQ13535 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRQ13535 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRQ13535 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRQ13535 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRQ13535 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRQ13535 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRQ13535 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRQ13535 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRQ13535 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRQ13535 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRQ13535 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRQ13535 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRQ13535 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRQ13535 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRQ13535 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRQ13535 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRQ13535 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRQ13535 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRQ13535 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRQ13535 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRQ13535 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRQ13535 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRQ13535 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRQ13535 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRQ13535 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRQ13535 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRQ13535 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRQ13535 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRQ13535 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRQ13535 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRQ13535 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRQ13535 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRQ13535 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRQ13535 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRQ13535 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRQ13535 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRQ13535 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRQ13535 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRQ13535 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRQ13535 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRQ13535 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRQ13535 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRQ13535 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRQ13535 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRQ13535 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRQ13535 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRQ13535 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRQ13535 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRQ13535 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRQ13535 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRQ13535 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRQ13535 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRQ13535 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRQ13535 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRQ13535 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRQ13535 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRQ13535 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRQ13535 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRQ13535 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRQ13535 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRQ13535 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRQ13535 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRQ13535 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRQ13535 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRQ13535 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRQ13535 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRQ13535 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRQ13535 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRQ13535 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRQ13535 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRQ13535 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRQ13535 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRQ13535 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRQ13535 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRQ13535 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRQ13535 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRQ13535 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRQ13535 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRQ13535 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATRQ13535 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATRQ13535 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATRQ13535 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATRQ13535 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATRQ13535 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATRQ13535 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATRQ13535 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATRQ13535 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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