Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSLNQ13421 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSLNQ13421 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
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