Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MRPL49Q13405 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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