Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TROQ12816 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TROQ12816 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TROQ12816 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TROQ12816 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TROQ12816 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TROQ12816 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TROQ12816 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
TROQ12816 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TROQ12816 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TROQ12816 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TROQ12816 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TROQ12816 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TROQ12816 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TROQ12816 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TROQ12816 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TROQ12816 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TROQ12816 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TROQ12816 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TROQ12816 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TROQ12816 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TROQ12816 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TROQ12816 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TROQ12816 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TROQ12816 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TROQ12816 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TROQ12816 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TROQ12816 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TROQ12816 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TROQ12816 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TROQ12816 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
TROQ12816 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TROQ12816 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TROQ12816 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TROQ12816 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TROQ12816 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
TROQ12816 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TROQ12816 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TROQ12816 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
TROQ12816 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TROQ12816 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
TROQ12816 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TROQ12816 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
TROQ12816 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
TROQ12816 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TROQ12816 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TROQ12816 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TROQ12816 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TROQ12816 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TROQ12816 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TROQ12816 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TROQ12816 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TROQ12816 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TROQ12816 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TROQ12816 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TROQ12816 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
TROQ12816 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TROQ12816 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
TROQ12816 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TROQ12816 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TROQ12816 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TROQ12816 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TROQ12816 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TROQ12816 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
TROQ12816 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TROQ12816 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TROQ12816 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TROQ12816 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TROQ12816 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TROQ12816 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TROQ12816 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TROQ12816 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TROQ12816 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TROQ12816 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TROQ12816 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TROQ12816 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TROQ12816 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TROQ12816 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TROQ12816 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TROQ12816 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TROQ12816 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TROQ12816 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TROQ12816 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TROQ12816 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
TROQ12816 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TROQ12816 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TROQ12816 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
TROQ12816 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TROQ12816 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TROQ12816 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TROQ12816 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TROQ12816 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TROQ12816 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TROQ12816 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TROQ12816 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TROQ12816 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TROQ12816 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TROQ12816 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TROQ12816 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TROQ12816 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
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