Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

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Length 1,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 TCB1YOR086C 3561 nt7.76□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.76□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.76□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.76□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 CUS1YMR240C 1311 nt7.76□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 RSC9YML127W 1746 nt7.75□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 RDR1YOR380W 1641 nt7.75□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 YDR056CYDR056C 618 nt7.75□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 HSP42YDR171W 1128 nt7.75□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 YGR064WYGR064W 369 nt7.75□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 PML1YLR016C 615 nt7.75□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 YLR326WYLR326W 723 nt7.75□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 LDB7YBL006C 543 nt7.75□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 VPS71YML041C 843 nt7.75□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 MRPL10YNL284C 969 nt7.75□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 MMT2YPL224C 1455 nt7.75□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 SOL3YHR163W 750 nt7.74□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 MRPL4YLR439W 960 nt7.74□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 YLR444CYLR444C 303 nt7.74□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt7.74□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 SPS19YNL202W 879 nt7.74□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 YPL225WYPL225W 441 nt7.74□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 PRC1YMR297W 1599 nt7.73□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 snR7-LsnR7-L 214 nt7.73□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 GIR2YDR152W 798 nt7.73□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 PGD1YGL025C 1194 nt7.73□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt7.73□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 YGL260WYGL260W 231 nt7.73□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 YKL118WYKL118W 312 nt7.73□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 ECM4YKR076W 1113 nt7.73□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 YIM2YMR151W 438 nt7.73□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt7.73□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 YAH1YPL252C 519 nt7.73□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 YMR027WYMR027W 1413 nt7.72□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 DAS1YJL149W 1992 nt7.72□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt7.72□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 PFD1YJL179W 330 nt7.72□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 SRP40YKR092C 1221 nt7.72□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 YBL010CYBL010C 843 nt7.72□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 YOL046CYOL046C 675 nt7.72□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 CYC2YOR037W 1101 nt7.72□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 SEC66YBR171W 621 nt7.72□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 RPT4YOR259C 1314 nt7.72□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 RCK1YGL158W 1539 nt7.72□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 ARP3YJR065C 1350 nt7.71□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 PHO3YBR092C 1404 nt7.71□□□□□ -1.17
NCR1Q12200 YER087C-AYER087C-A 552 nt7.71□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt7.71□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 IMP1YMR150C 573 nt7.71□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 POP7YBR167C 423 nt7.71□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 PLB2YMR006C 2121 nt7.7□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 CTF3YLR381W 2202 nt7.7□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 CIA1YDR267C 993 nt7.7□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 YEL010WYEL010W 351 nt7.7□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 MIG3YER028C 1185 nt7.7□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt7.7□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 VPS25YJR102C 609 nt7.7□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 ABM1YJR108W 372 nt7.7□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 MGM101YJR144W 810 nt7.7□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 BLI1YKL061W 342 nt7.7□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt7.7□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 PSF3YOL146W 585 nt7.7□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 PLP2YOR281C 861 nt7.7□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 TDA6YPR157W 1404 nt7.69□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 YIL108WYIL108W 2091 nt7.69□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 PMP3YDR276C 168 nt7.69□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt7.69□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 YJR023CYJR023C 402 nt7.69□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 RIB5YBR256C 717 nt7.69□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 SET4YJL105W 1683 nt7.69□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 GNP1YDR508C 1992 nt7.68□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 INO2YDR123C 915 nt7.68□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 BUD25YER014C-A 462 nt7.68□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 PET117YER058W 324 nt7.68□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 PUG1YER185W 912 nt7.68□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 MOB2YFL034C-B 864 nt7.68□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 PCL7YIL050W 858 nt7.68□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 YOL163WYOL163W 510 nt7.68□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 RFS1YBR052C 633 nt7.68□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 CUR1YPR158W 759 nt7.68□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 SLM5YCR024C 1479 nt7.68□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 PGI1YBR196C 1665 nt7.67□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 COQ4YDR204W 1008 nt7.67□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 YGL109WYGL109W 324 nt7.67□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 YGL117WYGL117W 798 nt7.67□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 FRA2YGL220W 363 nt7.67□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 YKL077WYKL077W 1179 nt7.67□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 RTT109YLL002W 1311 nt7.67□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 CIT1YNR001C 1440 nt7.67□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 YJL163CYJL163C 1668 nt7.67□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 YJR061WYJR061W 2808 nt7.66□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 snR65snR65 100 nt7.66□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 YDR535CYDR535C 501 nt7.66□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 VMA8YEL051W 771 nt7.66□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 YJR012CYJR012C 624 nt7.66□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 IMP2YMR035W 534 nt7.66□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 ASI2YNL159C 870 nt7.66□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 ARP4YJL081C 1470 nt7.66□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 HRR25YPL204W 1485 nt7.66□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 FUM1YPL262W 1467 nt7.66□□□□□ -1.18
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