Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C2orf54Q08AI8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C2orf54Q08AI8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms