Protein–RNA interactions for Protein: Q04759

PRKCQ, Protein kinase C theta type, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQQ04759 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKCQQ04759 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms