Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
IRX6P78412 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IRX6P78412 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IRX6P78412 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IRX6P78412 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IRX6P78412 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IRX6P78412 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IRX6P78412 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IRX6P78412 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IRX6P78412 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
IRX6P78412 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IRX6P78412 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
IRX6P78412 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IRX6P78412 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IRX6P78412 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
IRX6P78412 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
IRX6P78412 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IRX6P78412 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IRX6P78412 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
IRX6P78412 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
IRX6P78412 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IRX6P78412 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IRX6P78412 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IRX6P78412 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IRX6P78412 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IRX6P78412 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IRX6P78412 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IRX6P78412 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IRX6P78412 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IRX6P78412 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IRX6P78412 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IRX6P78412 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IRX6P78412 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IRX6P78412 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IRX6P78412 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IRX6P78412 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IRX6P78412 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IRX6P78412 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
IRX6P78412 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IRX6P78412 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IRX6P78412 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IRX6P78412 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IRX6P78412 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IRX6P78412 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IRX6P78412 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IRX6P78412 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IRX6P78412 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IRX6P78412 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IRX6P78412 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
IRX6P78412 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
IRX6P78412 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IRX6P78412 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IRX6P78412 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IRX6P78412 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IRX6P78412 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IRX6P78412 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IRX6P78412 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IRX6P78412 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
IRX6P78412 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IRX6P78412 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IRX6P78412 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
IRX6P78412 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IRX6P78412 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IRX6P78412 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IRX6P78412 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IRX6P78412 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
IRX6P78412 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
IRX6P78412 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
IRX6P78412 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IRX6P78412 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
IRX6P78412 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IRX6P78412 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
IRX6P78412 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IRX6P78412 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
IRX6P78412 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
IRX6P78412 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IRX6P78412 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IRX6P78412 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
IRX6P78412 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IRX6P78412 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
IRX6P78412 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
IRX6P78412 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IRX6P78412 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
IRX6P78412 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
IRX6P78412 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
IRX6P78412 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IRX6P78412 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IRX6P78412 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IRX6P78412 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IRX6P78412 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IRX6P78412 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
IRX6P78412 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
IRX6P78412 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IRX6P78412 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
IRX6P78412 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
IRX6P78412 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
IRX6P78412 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IRX6P78412 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
IRX6P78412 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IRX6P78412 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms