Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 493.8 ms