Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX2-1P43699 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms