Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACVR1BP36896 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACVR1BP36896 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACVR1BP36896 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACVR1BP36896 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACVR1BP36896 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACVR1BP36896 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACVR1BP36896 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACVR1BP36896 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ACVR1BP36896 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACVR1BP36896 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACVR1BP36896 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACVR1BP36896 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACVR1BP36896 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACVR1BP36896 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms