Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PEX2P28328 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PEX2P28328 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PEX2P28328 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PEX2P28328 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PEX2P28328 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PEX2P28328 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PEX2P28328 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PEX2P28328 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PEX2P28328 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PEX2P28328 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PEX2P28328 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PEX2P28328 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PEX2P28328 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PEX2P28328 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PEX2P28328 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PEX2P28328 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PEX2P28328 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PEX2P28328 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PEX2P28328 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PEX2P28328 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PEX2P28328 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PEX2P28328 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PEX2P28328 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PEX2P28328 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PEX2P28328 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PEX2P28328 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PEX2P28328 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PEX2P28328 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PEX2P28328 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PEX2P28328 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PEX2P28328 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PEX2P28328 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PEX2P28328 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PEX2P28328 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PEX2P28328 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PEX2P28328 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PEX2P28328 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PEX2P28328 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PEX2P28328 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PEX2P28328 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PEX2P28328 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PEX2P28328 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PEX2P28328 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PEX2P28328 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PEX2P28328 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PEX2P28328 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PEX2P28328 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PEX2P28328 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PEX2P28328 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PEX2P28328 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PEX2P28328 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PEX2P28328 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PEX2P28328 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PEX2P28328 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PEX2P28328 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PEX2P28328 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PEX2P28328 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PEX2P28328 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PEX2P28328 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PEX2P28328 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PEX2P28328 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PEX2P28328 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PEX2P28328 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PEX2P28328 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PEX2P28328 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PEX2P28328 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PEX2P28328 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PEX2P28328 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PEX2P28328 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PEX2P28328 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PEX2P28328 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PEX2P28328 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PEX2P28328 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PEX2P28328 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PEX2P28328 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PEX2P28328 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PEX2P28328 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PEX2P28328 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PEX2P28328 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PEX2P28328 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PEX2P28328 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PEX2P28328 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PEX2P28328 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PEX2P28328 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PEX2P28328 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PEX2P28328 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PEX2P28328 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PEX2P28328 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PEX2P28328 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PEX2P28328 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PEX2P28328 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PEX2P28328 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PEX2P28328 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PEX2P28328 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PEX2P28328 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PEX2P28328 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PEX2P28328 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PEX2P28328 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PEX2P28328 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms