Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC3P19447 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms