Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
ITGB4P16144 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms