Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXB3P14651 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms