Protein–RNA interactions for Protein: O60239

SH3BP5, SH3 domain-binding protein 5, humanhuman

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5O60239 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
SH3BP5O60239 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
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