Protein–RNA interactions for Protein: O43353

RIPK2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK2O43353 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RIPK2O43353 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIPK2O43353 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIPK2O43353 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIPK2O43353 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIPK2O43353 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK2O43353 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK2O43353 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK2O43353 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK2O43353 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK2O43353 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK2O43353 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK2O43353 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK2O43353 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK2O43353 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK2O43353 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK2O43353 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK2O43353 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK2O43353 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK2O43353 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK2O43353 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK2O43353 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK2O43353 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK2O43353 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK2O43353 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms