Protein–RNA interactions for Protein: O09161

Casq2, Calsequestrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq2O09161 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casq2O09161 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casq2O09161 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casq2O09161 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casq2O09161 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Casq2O09161 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Casq2O09161 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casq2O09161 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casq2O09161 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casq2O09161 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casq2O09161 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Casq2O09161 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casq2O09161 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casq2O09161 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casq2O09161 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casq2O09161 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casq2O09161 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casq2O09161 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casq2O09161 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casq2O09161 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casq2O09161 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casq2O09161 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casq2O09161 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casq2O09161 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casq2O09161 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casq2O09161 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casq2O09161 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casq2O09161 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casq2O09161 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casq2O09161 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casq2O09161 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casq2O09161 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casq2O09161 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casq2O09161 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casq2O09161 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casq2O09161 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casq2O09161 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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