Protein–RNA interactions for Protein: H7C1H1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1H1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H7C1H1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H7C1H1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H7C1H1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H7C1H1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H7C1H1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H7C1H1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H7C1H1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H7C1H1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H7C1H1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H7C1H1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H7C1H1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H7C1H1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H7C1H1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H7C1H1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H7C1H1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H7C1H1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H7C1H1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H7C1H1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H7C1H1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H7C1H1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H7C1H1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H7C1H1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H7C1H1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H7C1H1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H7C1H1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H7C1H1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H7C1H1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H7C1H1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H7C1H1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H7C1H1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H7C1H1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H7C1H1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H7C1H1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H7C1H1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H7C1H1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H7C1H1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H7C1H1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H7C1H1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H7C1H1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H7C1H1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H7C1H1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H7C1H1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H7C1H1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H7C1H1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H7C1H1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H7C1H1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H7C1H1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H7C1H1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H7C1H1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H7C1H1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H7C1H1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H7C1H1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H7C1H1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H7C1H1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H7C1H1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H7C1H1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H7C1H1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H7C1H1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H7C1H1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H7C1H1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H7C1H1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H7C1H1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C1H1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C1H1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C1H1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C1H1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C1H1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C1H1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C1H1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C1H1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C1H1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C1H1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C1H1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C1H1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C1H1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C1H1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C1H1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C1H1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C1H1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C1H1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C1H1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C1H1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C1H1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
H7C1H1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
H7C1H1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
H7C1H1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C1H1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C1H1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C1H1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C1H1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C1H1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C1H1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C1H1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C1H1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C1H1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C1H1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C1H1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C1H1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C1H1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms