Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 LMO1-201ENST00000335790 1279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 IL2RG-204ENST00000456850 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 LMO1-204ENST00000534484 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MCMBPQ9BTE3 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms