Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms