Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV99

LRRC61, Leucine-rich repeat-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC61Q9BV99 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LRRC61Q9BV99 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms