Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 TTTY14-204ENST00000452584 860 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 ETFRF1-207ENST00000556351 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP46P62068 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
USP46P62068 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP46P62068 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP46P62068 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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