Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LMO4P61968 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms