Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 MARCH10-201ENST00000311269 3090 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms