Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 SIGLEC17P-204ENST00000618545 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 IGHE-202ENST00000641420 1485 ntAPPRIS P5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 TAGLN2-201ENST00000320307 709 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 LY6G6F-201ENST00000375832 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 POLR3DP1-201ENST00000398689 1176 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 IL6RP1-201ENST00000417848 1273 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 IDI2-AS1-204ENST00000437374 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AL110503.1-201ENST00000457224 534 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AC079601.2-201ENST00000547729 775 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 MIR22HG-206ENST00000573127 899 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 MIR4526-201ENST00000583168 87 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AC104521.1-201ENST00000598582 279 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 PDLIM1P1-201ENST00000604187 969 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AL158032.2-201ENST00000616818 195 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 CDK7-201ENST00000256443 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 S100A7A-202ENST00000368728 440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 MRPL19-203ENST00000409374 1076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AC008267.3-201ENST00000448776 712 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 EEF1GP1-201ENST00000457231 1299 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 RPS23-205ENST00000510019 1019 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 INCA1-202ENST00000574617 1260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 NSRP1-213ENST00000584423 482 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 GPHB5-202ENST00000621500 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 C12orf45-205ENST00000622317 1078 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AL807742.1-201ENST00000636678 1160 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLD1P28340 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLD1P28340 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms