Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 PLA2G6-213ENST00000447598 567 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DMDP11532 SNHG11-214ENST00000457218 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DMDP11532 SLC10A7-208ENST00000511374 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DMDP11532 LINC02163-201ENST00000514769 574 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DMDP11532 ROM1-205ENST00000534093 862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC092069.1-201ENST00000589120 270 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DMDP11532 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DMDP11532 DNAJB8-202ENST00000469083 3365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DMDP11532 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 PLA2G2E-201ENST00000375116 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 PRDX4-201ENST00000379331 852 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 H1FOO-202ENST00000503977 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC131274.3-201ENST00000578745 1271 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 RPL37A-212ENST00000600880 425 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC105415.1-201ENST00000509015 1416 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 RABL2B-203ENST00000395591 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 SDR16C5-203ENST00000522671 1988 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 NTF3-201ENST00000331010 1028 ntAPPRIS P3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 RHCE-203ENST00000346452 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC244197.2-201ENST00000370438 655 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 SYCP3-203ENST00000392927 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 MYLK-AS1-203ENST00000485162 587 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 HNRNPA1P4-201ENST00000509706 756 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC022217.2-201ENST00000518941 472 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC002519.2-201ENST00000563575 539 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 CIRBP-AS1-201ENST00000585832 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC025165.4-201ENST00000602327 433 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC011306.1-201ENST00000606639 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 GPHB5-202ENST00000621500 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 NEK11-202ENST00000383366 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 OR2T33-201ENST00000318021 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 KRTAP10-10-201ENST00000380095 1100 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 PFN1P10-201ENST00000455962 327 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 AL356479.1-202ENST00000456933 714 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 AL390061.1-201ENST00000457804 293 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 AP001922.5-201ENST00000527803 651 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 KRT16P1-202ENST00000577750 679 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 ATXN10-212ENST00000640901 1185 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DMDP11532 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 WFDC2-201ENST00000217425 356 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 ROPN1B-201ENST00000251776 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 SCGB1C1-201ENST00000342878 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 ANO7-203ENST00000402530 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC092656.1-202ENST00000515843 998 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 OPN1MW-201ENST00000595290 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 CGREF1-209ENST00000640154 336 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 ACKR1-202ENST00000368122 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 VRK3-202ENST00000377011 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 AL358876.2-201ENST00000424689 477 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC074366.1-204ENST00000446277 552 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 BX284656.1-201ENST00000446364 668 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 LINC01297-202ENST00000453395 624 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC087441.1-201ENST00000531069 301 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC021594.2-201ENST00000592499 527 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC009061.2-204ENST00000602476 524 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 NDRG1-222ENST00000522476 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 NPPB-201ENST00000376468 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 IFNWP19-201ENST00000438727 566 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 ENTPD1-AS1-210ENST00000452942 864 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC098591.1-202ENST00000507914 937 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 BACH1-AS1-202ENST00000615718 700 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 MIR6741-201ENST00000618782 63 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DMDP11532 OPRM1-210ENST00000452687 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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