Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 PLA2G2E-201ENST00000375116 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms