Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC074019.1-201ENST00000428788 1096 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 BACE1-207ENST00000510630 1236 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 PEX11A-204ENST00000561224 529 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 DSCAS-201ENST00000581836 553 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 PACRG-AS3-204ENST00000620150 567 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AC008993.3-201ENST00000633603 631 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 SUCLG2-203ENST00000492795 1512 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AC015813.5-201ENST00000624641 1514 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 POLR2J2-203ENST00000476151 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AP001331.1-201ENST00000413008 1015 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AC079325.1-201ENST00000430386 857 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 TMEM256P1-201ENST00000430550 340 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 PTPA-219ENST00000435305 530 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 HNRNPA1P73-201ENST00000446472 928 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 BICD1P1-201ENST00000457832 1222 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 WASIR2-201ENST00000527434 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 FTH1-205ENST00000529631 507 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 PIGH-210ENST00000560722 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AC048380.1-201ENST00000589818 465 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AC116631.1-201ENST00000640685 576 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 GRP-201ENST00000256857 848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AC105443.1-201ENST00000433754 712 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AL133351.2-201ENST00000437718 484 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 Z84721.1-201ENST00000438841 372 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AC008808.2-201ENST00000510349 569 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AC114939.1-201ENST00000520980 514 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AC025048.4-201ENST00000589740 699 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AC018766.1-201ENST00000601211 484 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AL357558.2-201ENST00000431915 425 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 RPE-208ENST00000436630 1128 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 IDI2-AS1-204ENST00000437374 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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