Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 C2orf27AP1-201ENST00000618128 586 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RPS29P62273 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 SLC25A51P3-201ENST00000521814 889 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AC079336.3-201ENST00000577227 475 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms