Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AL355987.2-201ENST00000471502 561 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 HINT1-204ENST00000506908 681 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 LINC01606-208ENST00000521653 557 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 LINC02182-201ENST00000569362 498 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 SMIM17-201ENST00000598409 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 AC239600.1-201ENST00000603201 462 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 RN7SL827P-201ENST00000607480 288 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 AC020763.2-201ENST00000623155 1255 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 BHMT2-201ENST00000255192 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 AC100797.1-201ENST00000520760 316 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 AC073610.2-201ENST00000537495 406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 AC011479.2-201ENST00000598146 432 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 NBEAP3-201ENST00000420638 1493 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 IP6K2-201ENST00000328631 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 SYT17-204ENST00000562711 1702 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 RBP1-201ENST00000232219 898 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 AL662860.1-201ENST00000436804 877 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 CNBP-202ENST00000441626 1040 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 RPL21P135-201ENST00000442539 791 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 RPL7AP53-201ENST00000468834 793 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 RN7SL483P-201ENST00000478417 285 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 SPTY2D1-AS1-202ENST00000511927 573 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 HERC2P5-202ENST00000564458 1164 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 HERC2P8-203ENST00000564795 1164 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 AC010547.1-202ENST00000567341 230 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 AC026304.1-201ENST00000597953 561 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 DUSP22-206ENST00000603453 804 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 RBP1-206ENST00000617459 667 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 LINC00869-208ENST00000621156 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 AC015959.1-201ENST00000623263 1377 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 SERPINE3-203ENST00000521255 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 THYN1-202ENST00000352327 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 AC010163.1-201ENST00000434440 520 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 SRSF5-201ENST00000394366 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 AC073862.3-201ENST00000624597 1648 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 MYL7-201ENST00000223364 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 SYCE1-201ENST00000303903 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 AC159540.1-201ENST00000422600 555 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 RN7SL750P-201ENST00000582814 238 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 RPSAP67-201ENST00000584105 862 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 MIR6871-201ENST00000613433 56 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 DDX19B-208ENST00000563392 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 LUC7L-203ENST00000397780 1335 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 BX005132.1-201ENST00000641403 1580 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 TGFA-207ENST00000450929 950 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 CMC2-202ENST00000486645 766 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 AL136360.2-201ENST00000502636 581 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms