Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFTRP13569 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFTRP13569 LAMTOR2-203ENST00000368305 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFTRP13569 BCAR1P1-201ENST00000553953 636 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CFTRP13569 RN7SL750P-201ENST00000582814 238 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CFTRP13569 AL133551.1-201ENST00000610279 1222 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CFTRP13569 LINC01615-203ENST00000634877 673 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFTRP13569 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFTRP13569 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFTRP13569 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFTRP13569 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFTRP13569 RBFOX1-214ENST00000552089 1430 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFTRP13569 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFTRP13569 AC025538.1-201ENST00000510707 1486 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CFTRP13569 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFTRP13569 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFTRP13569 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFTRP13569 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFTRP13569 NPL-205ENST00000367555 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFTRP13569 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFTRP13569 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFTRP13569 RAP1A-201ENST00000356415 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFTRP13569 SARS2-205ENST00000594171 1631 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFTRP13569 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFTRP13569 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFTRP13569 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFTRP13569 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFTRP13569 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFTRP13569 NDUFB11-201ENST00000276062 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFTRP13569 AC105935.1-203ENST00000419183 600 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFTRP13569 LINC01606-208ENST00000521653 557 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFTRP13569 CBX3P4-202ENST00000540428 423 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFTRP13569 AC138305.1-201ENST00000568932 561 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFTRP13569 AC025165.4-201ENST00000602327 433 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CFTRP13569 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFTRP13569 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFTRP13569 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFTRP13569 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFTRP13569 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFTRP13569 MEG3-214ENST00000519709 1726 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFTRP13569 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFTRP13569 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFTRP13569 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFTRP13569 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFTRP13569 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFTRP13569 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFTRP13569 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFTRP13569 OR2T34-201ENST00000328782 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFTRP13569 OR2T3-201ENST00000359594 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFTRP13569 NDUFS5-201ENST00000372967 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFTRP13569 NDUFS5-202ENST00000372969 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFTRP13569 AC096677.3-201ENST00000413162 387 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CFTRP13569 HLA-DRB6-202ENST00000437183 1090 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CFTRP13569 RN7SL105P-201ENST00000475661 299 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CFTRP13569 BMF-209ENST00000561282 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFTRP13569 NPLOC4-214ENST00000573876 560 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFTRP13569 NAA60-236ENST00000577013 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFTRP13569 AD000091.1-201ENST00000592379 287 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CFTRP13569 DMRTC1-201ENST00000595412 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFTRP13569 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFTRP13569 AC244154.1-201ENST00000620148 1555 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CFTRP13569 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFTRP13569 TESPA1-202ENST00000449076 2010 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFTRP13569 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFTRP13569 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFTRP13569 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFTRP13569 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFTRP13569 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFTRP13569 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFTRP13569 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFTRP13569 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFTRP13569 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFTRP13569 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFTRP13569 TRAP1-201ENST00000246957 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFTRP13569 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFTRP13569 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFTRP13569 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CFTRP13569 ASGR2-201ENST00000254850 1396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFTRP13569 ASGR2-202ENST00000355035 1386 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFTRP13569 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFTRP13569 LUC7L-203ENST00000397780 1335 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFTRP13569 MRPL19-203ENST00000409374 1076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFTRP13569 MTND6P7-201ENST00000433237 524 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CFTRP13569 AC009517.1-201ENST00000454750 570 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CFTRP13569 AC106748.1-201ENST00000454801 384 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CFTRP13569 SLC10A7-208ENST00000511374 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFTRP13569 OPRM1-211ENST00000518759 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFTRP13569 AC106782.3-201ENST00000563429 258 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CFTRP13569 AL121992.3-201ENST00000606186 346 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CFTRP13569 PDLIM2-218ENST00000614502 599 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFTRP13569 C12orf45-205ENST00000622317 1078 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFTRP13569 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFTRP13569 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFTRP13569 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFTRP13569 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFTRP13569 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFTRP13569 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFTRP13569 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFTRP13569 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFTRP13569 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.1 ms