Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 GEMIN5-201ENST00000285873 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 VWA8-203ENST00000379310 7147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 DENND4C-205ENST00000434457 6718 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 DNM3-208ENST00000627582 7625 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 RAD1-203ENST00000382038 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 DLGAP1-212ENST00000515196 5314 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 DUSP22-211ENST00000604971 3824 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 SEC14L1-204ENST00000436233 5295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 SHPRH-202ENST00000367503 5237 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 FAM230B-208ENST00000451257 3566 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 PAX2-201ENST00000355243 4057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 AC099489.1-203ENST00000598234 10568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 AOC2-202ENST00000452774 2572 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 PLA1A-206ENST00000495992 1695 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 BCORL1-205ENST00000540052 7127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 BCL2L13-202ENST00000337612 4905 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 PUM2-203ENST00000361078 6251 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms