Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CntfP51642 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CntfP51642 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CntfP51642 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CntfP51642 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CntfP51642 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CntfP51642 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CntfP51642 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CntfP51642 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CntfP51642 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CntfP51642 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CntfP51642 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CntfP51642 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CntfP51642 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CntfP51642 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CntfP51642 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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CntfP51642 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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CntfP51642 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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CntfP51642 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CntfP51642 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CntfP51642 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CntfP51642 Olfr410-202ENSMUST00000213831 5070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CntfP51642 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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CntfP51642 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CntfP51642 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CntfP51642 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CntfP51642 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CntfP51642 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CntfP51642 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CntfP51642 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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CntfP51642 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CntfP51642 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CntfP51642 Clcn3-202ENSMUST00000056508 5684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CntfP51642 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
CntfP51642 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CntfP51642 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CntfP51642 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CntfP51642 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CntfP51642 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CntfP51642 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CntfP51642 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CntfP51642 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CntfP51642 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CntfP51642 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CntfP51642 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CntfP51642 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CntfP51642 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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CntfP51642 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
CntfP51642 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CntfP51642 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CntfP51642 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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CntfP51642 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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CntfP51642 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CntfP51642 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CntfP51642 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CntfP51642 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CntfP51642 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CntfP51642 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CntfP51642 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
CntfP51642 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CntfP51642 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CntfP51642 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CntfP51642 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CntfP51642 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CntfP51642 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CntfP51642 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CntfP51642 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CntfP51642 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CntfP51642 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CntfP51642 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CntfP51642 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CntfP51642 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CntfP51642 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CntfP51642 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CntfP51642 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CntfP51642 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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