Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC4Q9Y296 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC4Q9Y296 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms