Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HPS5Q9UPZ3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HPS5Q9UPZ3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms