Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HACL1Q9UJ83 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HACL1Q9UJ83 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HACL1Q9UJ83 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HACL1Q9UJ83 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HACL1Q9UJ83 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HACL1Q9UJ83 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HACL1Q9UJ83 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HACL1Q9UJ83 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HACL1Q9UJ83 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
HACL1Q9UJ83 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HACL1Q9UJ83 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HACL1Q9UJ83 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HACL1Q9UJ83 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
HACL1Q9UJ83 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HACL1Q9UJ83 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
HACL1Q9UJ83 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HACL1Q9UJ83 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HACL1Q9UJ83 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HACL1Q9UJ83 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HACL1Q9UJ83 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HACL1Q9UJ83 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HACL1Q9UJ83 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HACL1Q9UJ83 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HACL1Q9UJ83 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HACL1Q9UJ83 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HACL1Q9UJ83 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HACL1Q9UJ83 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HACL1Q9UJ83 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HACL1Q9UJ83 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HACL1Q9UJ83 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HACL1Q9UJ83 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HACL1Q9UJ83 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HACL1Q9UJ83 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HACL1Q9UJ83 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
HACL1Q9UJ83 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
HACL1Q9UJ83 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HACL1Q9UJ83 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HACL1Q9UJ83 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HACL1Q9UJ83 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HACL1Q9UJ83 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HACL1Q9UJ83 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HACL1Q9UJ83 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HACL1Q9UJ83 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HACL1Q9UJ83 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HACL1Q9UJ83 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HACL1Q9UJ83 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HACL1Q9UJ83 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HACL1Q9UJ83 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HACL1Q9UJ83 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HACL1Q9UJ83 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HACL1Q9UJ83 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms