Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
USP35Q9P2H5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
USP35Q9P2H5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
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