Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U1

ACTR3B, Actin-related protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3BQ9P1U1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTR3BQ9P1U1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACTR3BQ9P1U1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACTR3BQ9P1U1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACTR3BQ9P1U1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACTR3BQ9P1U1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACTR3BQ9P1U1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTR3BQ9P1U1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTR3BQ9P1U1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTR3BQ9P1U1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTR3BQ9P1U1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTR3BQ9P1U1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTR3BQ9P1U1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTR3BQ9P1U1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTR3BQ9P1U1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTR3BQ9P1U1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTR3BQ9P1U1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTR3BQ9P1U1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTR3BQ9P1U1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTR3BQ9P1U1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTR3BQ9P1U1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTR3BQ9P1U1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTR3BQ9P1U1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTR3BQ9P1U1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTR3BQ9P1U1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTR3BQ9P1U1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTR3BQ9P1U1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTR3BQ9P1U1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTR3BQ9P1U1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTR3BQ9P1U1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTR3BQ9P1U1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTR3BQ9P1U1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTR3BQ9P1U1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTR3BQ9P1U1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTR3BQ9P1U1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTR3BQ9P1U1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTR3BQ9P1U1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTR3BQ9P1U1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTR3BQ9P1U1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTR3BQ9P1U1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTR3BQ9P1U1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTR3BQ9P1U1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms