Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC59Q9P031 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms