Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHMP5Q9NZZ3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms