Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX3

NDUFA4L2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 4-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA4L2Q9NRX3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFA4L2Q9NRX3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NDUFA4L2Q9NRX3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NDUFA4L2Q9NRX3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NDUFA4L2Q9NRX3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
NDUFA4L2Q9NRX3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NDUFA4L2Q9NRX3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NDUFA4L2Q9NRX3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFA4L2Q9NRX3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFA4L2Q9NRX3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFA4L2Q9NRX3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFA4L2Q9NRX3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFA4L2Q9NRX3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFA4L2Q9NRX3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFA4L2Q9NRX3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFA4L2Q9NRX3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFA4L2Q9NRX3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFA4L2Q9NRX3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFA4L2Q9NRX3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFA4L2Q9NRX3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA4L2Q9NRX3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA4L2Q9NRX3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA4L2Q9NRX3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA4L2Q9NRX3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms