Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.3■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TIMMDC1Q9NPL8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms