Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
A4GALTQ9NPC4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
A4GALTQ9NPC4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms