Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP87

POLM, DNA-directed DNA/RNA polymerase mu, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLMQ9NP87 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLMQ9NP87 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms