Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC6

TMEM109, Transmembrane protein 109, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM109Q9BVC6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM109Q9BVC6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms