Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms