Protein–RNA interactions for Protein: Q96MS0

ROBO3, Roundabout homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO3Q96MS0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ROBO3Q96MS0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms